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ImageJ入門

• ImageJ安裝與配置
• 檔案格式與支援
• 數位影像基礎知識
• 從像素到微米：基礎測量與校正
• 從葉片學分析：空間校正、色彩空間與分割技巧

影像處理

• 影像對位
• 空間校正
• 強度校正
• 影像前處理
• binary mask image,label image與ROI的轉換
• 影像分割
• 其他分割
  • Laplacian of Gaussian
  • Difference of Gaussian（DoG）亮點偵測
• 形態學處理
  • 實作dot blob的分割與特徵擷取
  • 形態學處理範例-骨架化分析長度
  • 分析血管
• 去噪的其他方法
  • 形態學重建去噪
  • FFT（快速傅立葉轉換）
• 特徵擷取
• 紋理分析

案例介紹：分析胚胎

• 多目標測量：Roi manager與形態學分析

案例介紹：分析螢光影像

• 強度定量：分析細胞核質的訊號分佈

案例介紹：分析大腦

• 機器學習分割與體積、表面積分析

案例介紹：分析粒線體數量與體積，以及3D rendering

• 粒線體數量與體積分析

案例介紹：研究細胞的突起，如神經纖維

• SNT

其他

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• 自動化與巨集程式設計
• 方法學

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