ImageJ與Fiji的差異及安裝指南
簡介
Fiji（Fiji Is Just ImageJ）是imagej + 預裝plugins。推薦使用Fiji進行醫學影像分析。
版本比較
ImageJ
- 核心功能精簡
- 運行速度較快
- 佔用資源少
- 適合基礎影像處理（Image Processing）
- 需要手動安裝插件（Plugins）
FIJI
- 預裝大量插件（Plugins）
- 更新頻率較高
- 內建教學資源
- 適合進階分析（Advanced Analysis）
- 佔用空間較大
功能特色比較
| 功能 | ImageJ | Fiji |
|---|---|---|
| 基礎影像處理（Image Processing） | ✓ | ✓ |
| Bio-Formats 支援 | 需額外安裝 | 內建 |
| 3D 影像分析（3D Image Analysis） | 需額外安裝 | 內建 |
| 機器學習支援（Machine Learning） | 需額外安裝 | 內建基礎功能 |
Fiji安裝步驟
1. 下載 Fiji
FIJI官方網站 下載適合您作業系統的版本： - Windows 64-bit - Windows 32-bit - macOS（Intel/Apple Silicon） - Linux（64-bit）
2. 安裝與設定
- 解壓縮下載的檔案到您想安裝的位置
- 執行 fiji-windows-x64.exe
- 執行
Help > Update ImageJ... - 執行
Help > Update...
注意事項 - 建議安裝在非系統槽（如D槽）的純英文路徑 - 確保安裝位置有足夠的硬碟空間（約2GB） - 需要網路連接進行自動更新 - 可能需要管理員權限進行安裝
記憶體設定
調整記憶體分配
Edit > Options > Memory & Threads- 建議設定：
- 最大記憶體（Maximum Memory）：系統RAM的70%
- 執行緒數量（Parallel Threads）：CPU核心數-1