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ROI選擇與管理

ROI基礎概念

什麼是ROI

ROI類型

  1. 基本形狀
    • 矩形 (Rectangle)
    • 橢圓 (Oval)
    • 線段 (Line)
    • 點 (Point)
  2. 進階形狀
    • 多邊形 (Polygon)
    • 自由手繪 (Freehand)
    • 魔術棒 (Wand)
    • 選擇筆刷 (Selection Brush)

ROI工具使用

選擇工具

進階功能

測量與分析

基本測量

  1. 幾何測量 Analyze > Measure

    • 面積
    • 周長
    • 中心點座標
    • 方向
  2. 密度測量

    • 平均灰度值
    • 積分密度
    • 標準差
    • 最大/最小值

統計分析

  1. 數據收集

    • 批次測量
    • 數據表格
    • 結果匯出
  2. 統計處理

    • 基本統計
    • 直方圖分析
    • 相關性分析

ROI保存與讀取

檔案格式

  1. ROI檔案

    • .roi(單個ROI)
    • .zip(ROI集合)
    • 檔案結構
  2. 設置保存

    • 測量參數
    • 顯示選項
    • 分析設定

批次處理

  1. 載入ROI ROI Manager > More > Open...

    • 批次導入
    • 自動對應
    • 錯誤處理
  2. 應用ROI

    • 批次測量
    • 區域處理
    • 結果輸出

實際應用案例

細胞分析

  1. 細胞計數

    • 自動檢測
    • 手動校正
    • 結果統計
  2. 形態測量

    • 大小分布
    • 形狀分析
    • 密度評估

組織分析

  1. 區域分割

    • 組織分層
    • 結構識別
    • 面積計算
  2. 密度分析

    • 染色強度
    • 分布特徵
    • 時序變化

進階技巧

自動化處理

  1. 巨集錄製 Plugins > Macros > Record...
    • 操作錄製
    • 參數設置
    • 批次執行

多通道應用

  1. 通道同步

    • ROI複製
    • 位置對應
    • 數據關聯
  2. 共定位分析

    • 重疊區域
    • 信號相關
    • 定量評估

實作練習

練習 1:基本ROI操作

  1. 建立不同類型的ROI
  2. 修改和調整ROI
  3. 使用ROI manager
  4. 保存和讀取ROI

練習 2:進階ROI應用

  1. ROI的組合運算
  2. 批次ROI處理
  3. 自動ROI生成
  4. ROI based分析