ROI選擇與管理
ROI基礎概念
什麼是ROI
- Region of Interest(感興趣區域)
- 用於標記和分析特定區域
- 支援多種形狀和類型
- 可以保存和重複使用
- 影像中特定的選擇區域
- 用於局部分析和測量
- 可以保存和重複使用
- 支援多種幾何形狀
ROI類型
- 基本形狀
- 矩形 (Rectangle)
- 橢圓 (Oval)
- 線段 (Line)
- 點 (Point)
- 進階形狀
- 多邊形 (Polygon)
- 自由手繪 (Freehand)
- 魔術棒 (Wand)
- 選擇筆刷 (Selection Brush)
ROI工具使用
選擇工具
-
矩形工具(Rectangle Tool)
- 按住Shift:正方形
- 按住Alt:以中心點展開
-
橢圓工具(Oval Tool)
- 按住Shift:正圓
- 按住Alt:以中心點展開
-
多邊形工具(Polygon Tool)
- 單擊:添加頂點
- 雙擊:完成選擇
- 按住Shift:限制角度
-
修改ROI
- 移動:按住左鍵拖曳
- 調整大小:拖曳邊界點
- 旋轉:CTRL + 拖曳
- 添加/減去區域
進階功能
- ROI管理器
Analyze > Tools > ROI Manager...
- ROI操作
- 開啟ROI管理器:
Analyze > Tools > ROI Manager
- 添加ROI:
Add
- 刪除ROI:
Delete
- 重命名ROI:
Rename
- 顯示所有ROI:
Show All
- 分割
- 複製/貼上
- 填充/清除
- 開啟ROI管理器:
- ROI組合
- 多個ROI合併
- 交集運算
- 聯集運算
- 差集運算
測量與分析
基本測量
-
幾何測量
Analyze > Measure
- 面積
- 周長
- 中心點座標
- 方向
-
密度測量
- 平均灰度值
- 積分密度
- 標準差
- 最大/最小值
統計分析
-
數據收集
- 批次測量
- 數據表格
- 結果匯出
-
統計處理
- 基本統計
- 直方圖分析
- 相關性分析
ROI保存與讀取
檔案格式
-
ROI檔案
- .roi(單個ROI)
- .zip(ROI集合)
- 檔案結構
-
設置保存
- 測量參數
- 顯示選項
- 分析設定
批次處理
-
載入ROI
ROI Manager > More > Open...
- 批次導入
- 自動對應
- 錯誤處理
-
應用ROI
- 批次測量
- 區域處理
- 結果輸出
實際應用案例
細胞分析
-
細胞計數
- 自動檢測
- 手動校正
- 結果統計
-
形態測量
- 大小分布
- 形狀分析
- 密度評估
組織分析
-
區域分割
- 組織分層
- 結構識別
- 面積計算
-
密度分析
- 染色強度
- 分布特徵
- 時序變化
進階技巧
自動化處理
- 巨集錄製
Plugins > Macros > Record...
- 操作錄製
- 參數設置
- 批次執行
多通道應用
-
通道同步
- ROI複製
- 位置對應
- 數據關聯
-
共定位分析
- 重疊區域
- 信號相關
- 定量評估
實作練習
練習 1:基本ROI操作
- 建立不同類型的ROI
- 修改和調整ROI
- 使用ROI manager
- 保存和讀取ROI
練習 2:進階ROI應用
- ROI的組合運算
- 批次ROI處理
- 自動ROI生成
- ROI based分析