粒子分析
簡介
粒子分析是ImageJ中一個強大的功能，可用於自動檢測和測量影像中的物件。本章節將介紹如何使用粒子分析工具進行物件的檢測、計數和測量。
基本概念
什麼是粒子分析？
- 物件識別與計數
- 形態特徵測量
- 自動化分析
- 結果統計
應用場景
- 細胞計數
- 核計數
- 顆粒分析
- 群落計數
前處理步驟
影像優化
- 對比度增強
Image > Adjust > Brightness/Contrast- 自動調整
-
手動優化
-
雜訊去除
- 中值濾波
- 高斯濾波
- 背景去除
二值化
- 閾值設定
- 手動閾值
- 自動閾值
- 局部閾值
- 二值化優化
- 填充孔洞
- 平滑邊緣
- 分離連接物件
粒子分析設定
基本參數
- 使用
Analyze > Analyze Particles - 大小範圍設定
- 圓度範圍
- 排除邊緣物件
顯示選項
- Outlines（輪廓）
- Masks（遮罩）
- Overlay（疊加）
- Nothing（僅結果）
測量選項
- 面積
- 周長
- 圓度
- Feret直徑
- 形狀描述子
結果分析
數值結果
- Summary
- 物件總數
- 平均大小
- 總面積
-
密度
-
詳細測量
- 個別物件資訊
- 位置座標
- 形態參數
- 強度資訊
結果驗證
- 視覺檢查
- 手動驗證
- 統計分析
- 異常檢測
進階應用
多通道分析
- 通道間比較
- 共定位分析
- 多重標記
- 相關性分析
時間序列分析
- 動態追蹤
- 生長分析
- 運動分析
- 形態變化
3D粒子分析
- Z-stack分析
- 體積測量
- 3D重建
- 立體定量
批次處理
批次分析設置
- 檔案組織
- 參數設定
- 結果保存
- 錯誤處理
自動化流程
- 巨集錄製
- 參數優化
- 結果整合
- 報告生成
實作練習
練習 1：基本粒子分析
- 影像預處理
- 設定分析參數
- 執行分析
- 結果解釋
練習 2：進階應用
- 多通道粒子分析
- 時間序列追蹤
- 批次處理
- 數據統計
常見問題解決
Q: 物件識別不完整？
A: 優化預處理步驟，調整閾值設定，考慮使用分水嶺分割。
Q: 物件重疊嚴重？
A: 使用分水嶺分割，調整大小和圓度過濾，必要時手動分離。
Q: 批次處理結果不一致？
A: 標準化處理流程，確保參數設定一致，加入品質控制步驟。